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海關(guān)對進出口貨物報關(guān)管理的主要制度實際是報關(guān)注冊登記制度,，凡是在中華人民共和國進出境口岸辦理進出口貨物報關(guān)手續(xù)的企業(yè)必須向海關(guān)辦理報關(guān)注冊登記。
進口貨物報關(guān)單一般填寫一式二份,，報關(guān)單填報項目要準確,、齊全、字跡清楚,，不能用鉛筆;報關(guān)單內(nèi)各欄目，凡海關(guān)規(guī)定有統(tǒng)計代號的,，以及稅則號列及稅率一項,，由報關(guān)員用紅筆填寫;每份報關(guān)單限填報四項貨物;如發(fā)現(xiàn)情況有無或其他情況需變更填報內(nèi)容的，應主動,、及時向海關(guān)遞交更改單,。
出口貨物報關(guān)單一般填寫一式兩份，填單要求與進口貨物報關(guān)單基本相同,。
如因填報有誤或需變更填報內(nèi)容而未主動,、及時更改的，出口報關(guān)后發(fā)生退關(guān)情況,，報關(guān)單位應在三天內(nèi)向海關(guān)辦理更正手續(xù),。
隨報關(guān)單交驗的貨運、商業(yè)單據(jù)任何進出口貨物通過海關(guān)，都必須在向海關(guān)遞交以填好的報關(guān)單的同時,，交驗有關(guān)的貨運和商業(yè)單據(jù),，接受海關(guān)審核諸種單證是否一致，并由海關(guān)審核后加蓋印章,，作為提取或發(fā)運貨物的憑證,。
隨報關(guān)單同時交驗的貨運和商業(yè)單據(jù)有：海運進口提貨單;海運出口裝貨單(需報關(guān)單位蓋章);陸、空運運單;貨物的發(fā)票(其份數(shù)比報關(guān)單少一份,，需報關(guān)單位蓋章等);貨物的裝箱單(其份數(shù)與發(fā)票相等,，需報關(guān)單位蓋章)等。
需要說明的是如海關(guān)認為必要,，報關(guān)單位還應交驗貿(mào)易合同,、定貨卡片、產(chǎn)地證明等,。
另外,，按規(guī)定享受減、免稅或免驗的貨物,，應在向海關(guān)申請并已辦妥手續(xù)后,，隨報關(guān)單交驗有關(guān)證明文件。
進出口報關(guān)的操作流程：　　出口:　　一,、出口報關(guān)企業(yè)應具備在當?shù)睾ｊP(guān),、檢驗檢疫局注冊備案，有進出口經(jīng)營權(quán)和報檢,。
　　二,、出口報關(guān)所需單證：　　1.客戶就在貨物運抵海關(guān)區(qū)后，裝貨的之前,，備齊海關(guān)所需單證向海關(guān)申報,。
　　2.必備單證：清單合同、核銷單,、報關(guān)委托書,、船公司裝貨單等單各一份。
　　3.按海關(guān)稅則所規(guī)定的各項,。
(如通關(guān)單,、出口許可證等)　　4.有出口手冊需提供手冊報關(guān)。
　　三,、出口報檢所需單證：　　1.客戶應在報關(guān)之日天備齊所需單證,，向檢驗檢疫局申報。
提供單證有：清單,、合同,、報檢委托書,、廠檢單、紙箱包裝單等各一份,。
　　2.出口貨物到美國,、澳大利亞、加拿大,、歐盟等外包裝為木制的需做熏蒸或熱處理的,，客戶所提供的單證有：清單合同、報檢委托書,。
如熏蒸產(chǎn)品是木制品,，還需提供廠檢單。
　　3.做熏蒸或熱處理的產(chǎn)品,，客戶應在報關(guān)前兩天,，將貨物運抵到的堆場或港區(qū)進行熏蒸。
（熏蒸時間需）　　四,、出口報關(guān)正式向海關(guān)申報,。
如出口需繳納稅費的，應及時繳納稅費,。
　　五,、海關(guān)現(xiàn)場審單結(jié)束。
貨物單證放行后,，貨主應在海關(guān)規(guī)定的時間內(nèi)將貨物運至海關(guān)區(qū)內(nèi)進行驗放,。
如需查驗，報關(guān)行應及時與海關(guān)聯(lián)系,，進行貨物查驗,，驗完后需按船公司封鉛封。
不需查驗的應及時進行實貨放行,，將裝貨單按截關(guān)時間送到港區(qū)裝船,。
　　六、待貨物出口,，船公司就將出口艙單數(shù)據(jù)傳送海關(guān),，海關(guān)接收到數(shù)據(jù)后報關(guān)行待海關(guān)數(shù)據(jù)結(jié)關(guān)后，及時到海關(guān)打印退稅核銷聯(lián),。
　　七,、出口通關(guān)結(jié)束,。
　　進口:　　一,、客戶提供到貨通知書、正本提單或電放保函及換單費,、THC費等給我司,由我司代客戶到所屬船公司換取進口提貨單,。
　　二、準備進口報關(guān)所需單證　　1.必備單證：清單 合同一式一份、報關(guān),、報檢委托書各一份,。
　　2.從歐盟、美國,、韓國,、日本進口貨物，如是木制包裝箱的需提供熱處理證書或植物檢疫證書,，如是非木制的提供無木制包包裝,。
　　3.稅則所規(guī)定的各項（如進口許可證 重要工業(yè)品證書）　　4.有減免稅手冊的提供減免稅手冊。
　　三,、進口申報后如海關(guān)審價需要,，客戶需提供相關(guān)價格。
如信用證,、保單,、原廠、招標書等海關(guān)所要求的文件,。
　　四,、海關(guān)打印稅單后，客戶需在7個工作日繳納稅費,。
如超過期限,，海關(guān)按日計征滯納金。
　　五,、報關(guān)查驗放行后,，客戶需及時到我司繳納報關(guān)、報檢代墊代辦費,。
　　※貨物到港后十四日內(nèi)必需向海關(guān)申報,。
如超過期限海關(guān)按日計征滯報金（按貨物價值萬分之五）超過三個月，海關(guān)將作無主貨物進行變賣,。
進(出)口貨物許可證進出口貨物許可證制度,，是對進出口貿(mào)易進行管理的一種行政保護手段。
我國與世界上大多數(shù)國家一樣,，也采用這一制度對進出口貨物,、物品實行全面管理。
必須向海關(guān)交驗進出口貨物許可證的商品并不固定,，而是由國家主管部門隨時調(diào)整公布,。
凡按國家規(guī)定應申領(lǐng)進出口貨物許可證的商品，報關(guān)時都必須交驗由對外貿(mào)易管理部門簽發(fā)的進出口貨物許可證,，并經(jīng)海關(guān)查驗合格無誤后始能放行,。
但對外經(jīng)濟貿(mào)易合作部所屬的進出口公司,、經(jīng)國務院批準經(jīng)營進出口業(yè)務的個部位所屬的工貿(mào)公司、個省(直轄市,、自治區(qū))所屬的進出口公司,，在批準的經(jīng)營范圍內(nèi)進出口商品，視為以取得許可,，免領(lǐng)進出口貨物許可證,，只憑報關(guān)單即可向海關(guān)申報;只有在經(jīng)營進出口經(jīng)營范圍以外的商品時才需要交驗許可證。
商檢證書海關(guān)指示報關(guān)單位出具商檢證書,，一方面是監(jiān)督法定檢驗商品是否已經(jīng)接受法定的商檢機構(gòu)檢驗;另一方面是取得進出口商品征稅,、免稅、減稅的依據(jù),。
根據(jù)《中華人民共和國進出口商品檢驗法》以及《商檢機構(gòu)實施檢驗的進出口商品種類表》規(guī)定,，凡列入《種類表》的法定檢驗的進出口商品，均應在報關(guān)前向商品檢驗機構(gòu)報驗,。
報關(guān)時,，對進口商品，海關(guān)憑商檢機構(gòu)簽發(fā)的檢驗證書或在進口貨物報關(guān)單上加蓋的印章驗收,。
除上述單證外,，對國家規(guī)定的其他進出口管制貨物，報關(guān)單位也必須向海關(guān)提交由國家主管部門簽發(fā)的特定的進出口貨物批準單證,，由海關(guān)查驗合格無誤后再予以放行,。
諸如食品衛(wèi)生檢驗，藥品檢驗,，動植物檢疫,，文物出口簽定，金銀及其制品的管理,，珍貴稀有野生動物的管理,，進出口射擊運動、狩獵用槍彈和民用爆破物品的管理,，進出口音像制品的管理等均屬此列,。
(二)進出口貨物的查驗進出口貨物，除海關(guān)總署特準查驗的以外,，都應接受海關(guān)查驗,。
查驗的目的是核對報關(guān)單證所報內(nèi)容與實際到貨是否相符，有無錯報,、漏報,、瞞報、偽報等情況,，審查貨物的進出口是否合法,。
海關(guān)查驗貨物，應在海關(guān)規(guī)定的時間和場所進行,。
如有特殊理由,，事先報經(jīng)海關(guān)同意，海關(guān)可以派人員在規(guī)定的時間和場所以外查詢,。
申請人應提供往返交通工具和住宿并支付費用,。
海關(guān)查驗貨物時，要求貨物的`收,、發(fā)貨人或其代理人必須到場,，并按海關(guān)的要求負責辦理貨物的搬移、拆裝箱和查驗貨物的包裝等工作,。
海關(guān)認為必要時,，可以徑行開驗、復驗或者提取貨樣,、貨物保管人應當?shù)綀鲎鳛橐娮C人,。
注意事項：(1)接到客戶全套單據(jù)后，應確認貨物的商品編碼,，然后查閱海關(guān)稅則,，確認進口稅率、確認貨物需要什么監(jiān)管條件,，如需做各種檢驗,，則應在報關(guān)前向有關(guān)機構(gòu)報驗。
報驗所需單據(jù)：報驗申請單,、正本箱單發(fā)票,、合同、進口報關(guān)單兩份,。
(2)換單時應催促船舶代理部門及時給海關(guān)傳艙單,，如有問題應與海關(guān)艙單室取得聯(lián)系，確認艙單是否轉(zhuǎn)到海關(guān),。
(3)當海關(guān)要求開箱查驗貨物時,，應提前與場站取得聯(lián)系，調(diào)配機力將所查箱子調(diào)至海關(guān)指定的場站,。
(事先應與場站確認好調(diào)箱費,、掏箱費。
)2.若是法檢商品應辦理驗貨手續(xù),。
如需商檢,，則要在報關(guān)前，拿進口商檢申請單(帶公章)和兩份報關(guān)單辦理登記手續(xù),，并在報關(guān)單上蓋商檢登記在案章以便通關(guān),。
驗貨手續(xù)在最終目的地辦理,。
如需動植檢，也要在報關(guān)前拿箱單發(fā)票合同報關(guān)單去代報驗機構(gòu)申請報驗,，在報關(guān)單上蓋放行以便通關(guān),，驗貨手續(xù)可在通關(guān)后堆場進行。